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李赛 博士

研究员

个人履历

2002-2006武汉大学应用物理系 学士

2006-2008德国斯图加特大学物理系 硕士

2009-2012德国哥廷根大学生物物理系 博士

2013-2017英国牛津大学粒子成像中心 博士后

2017-2018英国牛津大学粒子成像中心 副研究员

2018- 至今清华大学生命科学学院 研究员

主要科研领域与方向

三维成像的方式多样,从CT、荧光显微镜到电子显微镜,它们的成像尺度和分辨率各有千秋。冷冻电镜断层成像技术(Cryo-Electron Tomography, cryo-ET)是将置于透射电镜样品台上的冷冻样品沿一个固定轴旋转,并从不同角度对样品区域拍照获得倾转系列,并将其重构为三维图像,再使用子断层平均法(sub-tomogram averaging)进行结构解析的方法。使用cryo-ET能获得原始三维数据,这不仅可以用于解析蛋白质在细胞内的原位结构,也可应用于分子层面,对超大型或难以纯化或结晶的蛋白质复合物进行结构解析。具体应用包括:1)蛋白质在其载体上或功能状态中的原位结构;2)大分子复合物的高级结构,包括蛋白质、双层脂膜等的landscape及其相互作用信息;3)不易在体外重组表达的复合物结构,以及4)囊膜病毒-宿主相互作用等。超快倾转系列数据收集方法;提高子断层平均法分辨率;使用聚焦离子束切割并解析原位结构;光学-电子显微镜联合使用以及相位板技术都是cryo-ET日后的发展趋势。以上的方法及应用也是本课题组的工作目标。

代表性论文

1. Halldorsson S*, Li S*, Li M, Harlos K, Bowden TA, Huiskonen JT. Shielding and activation of a viral membrane fusion protein. Nat Commun. 2018; 9: 349. doi: 10.1038/s41467-017-02789-2.

2. Watanabe Y, Raghwani J, Allen JD, Seabright GE, Li S, Moser F, Huiskonen JT, Strecker T, Bowden TA, Crispin M. Structure of the Lassa virus glycan shield provides a model for immunological resistance. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2018, 115(28): 7320.

3. Li S, Rissanen I, Zeltina A, Hepojoki J, Raghwani J, Harlos K, Pybus OG, Huiskonen JT, Bowden TA. A molecular-level account of the antigenic hantaviral surface. Cell Rep. 2016;16(1):278. doi: 10.1016/j.celrep.2016.06.039.

4. Li S, Sun Z, Pryce R, Parsy ML, Fehling SK, Schlie K, Siebert CA, Garten W, Bowden TA, Strecker T, Huiskonen JT. Acidic pH-induced conformations and LAMP1 binding of the Lassa virus glycoprotein spike. PLoS Pathog. 2016; 12(2):e1005418. doi: 10.1371/journal.ppat.1005418.

5. Huiskonen JT, Parsy ML, Li S, Bitto D, Renner M, Bowden TA. Averaging of viral envelope glycoprotein spikes from electron cryotomography reconstructions using Jsubtomo. J Vis Exp. 2014 Oct 21;(92):e51714. doi: 10.3791/51714.

6. Li S*, Sieben C*, Ludwig K, Höfer CT, Chiantia S, Herrmann A, Eghiaian F, Schaap IA. pH-Controlled two-step uncoating of influenza virus. Biophys J. 2014; 106(7):1447-56. doi: 10.1016/j.bpj.2014.02.018.

7. Li S, Eghiaian F, Sieben C, Herrmann A, Schaap IA. Bending and puncturing the influenza lipid envelope. Biophys J. 2011; 100(3): 637–645. doi: 10.1016/ j.bpj.2010.12.3701.

8. Hoos F, Li S, Meyrath TP, Braun B, Giessen H. Thermal lensing in an end-pumped Yb: KGW slab laser with high power single emitter diodes. Opt Express. 2008 Apr 28; 16(9):6041-9.