联系方式

电话:010-62794737(实验室)

邮箱:hgong@tsinghua.edu.cn

龚海鹏 博士

研究员

个人履历

1993-1997清华大学生物科学与技术系 学士

1997-2000清华大学生物科学与技术系 硕士

2000-2006约翰霍普金斯大学生物物理学 博士

2006-2007约翰霍普金斯大学生物物理学 博士后

2007-2009芝加哥大学生物化学和分子生物学 博士后

2007-2009清华大学生命科学学院 助理教授

2015- 至今清华大学生命科学学院 副教授

主要科研领域与方向

1. 发展计算机算法根据氨基酸序列预测蛋白质三维结构

2. 发展分子动力学模拟的新方法用于定量分析生物大分子的大尺度构象变化

代表性论文

1. Ke M, Yuan Y, Jiang X, Yan N, Gong H*. (2017) Molecular determinants for the thermodynamic and functional divergence of uniporter GLUT1 and proton symporter XylE. PLoS Comput Biol, 13(6): e1005603.

2. Xiong D, Zeng J, Gong H*. (2017) A deep learning framework for improving long-range residue-residue contact prediction using a hierarchical strategy. Bioinformatics, 33(17): 2675-2683.

3. Sun RN, Gong H*. (2017) Simulating the activation of voltage sensing domain for a voltage-gated sodium channel using polarizable force field. J Phys Chem Lett, 8: 901-908.

4. Wang T, Yang Y, Zhou Y, Gong H*. (2017) LRFragLib: an effective algorithm to identify fragments for de novo protein structure prediction, Bioinformatics, 33(5): 677-684.

5. Xu L, Xia M, Guo J, Sun X, Li H, Xu C, Gu X, Zhang H, Yi J, Fang Y, Xie H, Wang J, Shen Z, Xue B, Sun Y, Meckel T, Chen YH, Hu Z, Li Z*, Xu C*, Gong H*, Liu W*. (2016) Impairment on the lateral mobility induced by structural changes underlies the functional deficiency of the lupus-associated polymorphism FcγRIIB-T232. J Exp Med., 213(12): 2707-2727.

6. Liu Y, Ke M, Gong H*. (2015) Protonation of Glu135 facilitates the outward-to-inward structural transition of fucose transporter. Biophys J, 109(3): 542-551.