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结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.1

2022/03/14

上周发布了哪些“结构”文章?又取得了哪些科研进展?

结构速递栏目以每周“结构”相关领域刊文为主题,梳理一周结构发文大事记,“结构速递”为您传递最新、最快、最权威的结构资讯。


2022.3.7~2022.3.13

CNS刊登文章


Cell

2022/03/ 09



Broad neutralization of SARS-CoV-2 variants by an inhalable bispecific single-domain antibody

由于新冠病毒突变株的不断出现,导致其中和抗体和疫苗的有效性大大下降,而且单抗药物一般以注射方式给药,抗体从血液循环到呼吸道病毒感染部位的有限扩散使得抗体难以有效到达肺部。复旦大学基础医学院应天雷与复旦大学生物医学研究院孙蕾以及复旦大学基础医学院吴艳玲合作,首先鉴定了能广泛中和抗体识别的 Omicron 突变株受体识别区域(RBD)上两个高度保守区域。此外,生成了一种双特异性的仅有27 kDa的全人源纳米抗体,研究人员利用低温冷冻电镜解析了全人源纳米双抗与Omicron三聚体S蛋白的结构,发现该抗体能够同时协同地结合单个 Omicron 变体 RBD 上的这两个区域,并通过后续实验中证明了这种双特异性抗体可以通过吸入给药有效地输送到肺部,在 SARS-CoV-2 感染的小鼠模型中表现出出色的中和广度和治疗效果。该抗体正在推进临床转化,已经进入中试生产阶段,有望被开发成为广谱特效治疗药物。重要的是,这项研究还发现了在病毒刺突蛋白三聚体界面内一类不常见且高度保守的隐藏的表位,对设计广谱SARS-CoV-2疫苗和药物的研发具有启示作用。


原 文 链 接

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)00269-0



Science

2022/03/ 10



Structure of a Janus kinase cytokine receptor complex reveals the basis for dimeric activation

细胞因子通过与细胞表面的跨膜受体细胞外结构域结合来启动信号传导,并促进受体二聚化,这种细胞外的受体二聚化导致非共价结合的 Janus 激酶 (JAK) 的激活和反式磷酸化。一旦被激活,JAK 会磷酸化细胞因子受体胞内结构域 (ICD) 内的酪氨酸残基,其随后充当信号转导和转录激活因子(STATs)的停靠位点。STATs 募集到受体-JAK 复合物上通过活化的 JAKs 使 STAT 磷酸化,导致 STAT 二聚化和易位到细胞核以启动细胞因子趋化因子的转录。细胞因子受体、JAK 和 STAT 中自然发生的突变会导致人类免疫缺陷和骨髓增殖性疾病。在2005 年发表的的一系列经典论文 中,JAK2 的 PK 域中的点突变 Val617→Phe (V617F),在大于90%的真性红细胞增多症患者和约 50% 的原发性血小板增多症和原发性骨髓纤维化患者中被发现。


斯坦福大学霍华德·休斯医学研究所的克里斯托弗·加西亚团队报告了与细胞因子受体胞内Box1/Box2 结构域结合的全长小鼠JAK1 的 3.6 Å 分辨率的冷冻电镜复合物结构,是一个携带有在骨髓增殖性肿瘤中普遍存在的 Val→Phe (VF) 突变位点的处在激活状态的同源二聚体。JAK1 的七个结构域形成一个扩展的结构单元,其二聚化界面由紧密堆积的假性激酶 (PK) 结构域介导。致癌 VF 突变位于 JAK1 PK 二聚体界面的核心以促进配体非依赖性激活。激活状态的JAK 突变体的结构为两步变构激活机制提供了证据,并且为更好地靶向致癌 JAK信号的选择性治疗提供了机会。


原 文 链 接

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abn8933



Nature

本 周 无




子刊刊登文章

Nature Structural & Molecular Biology


07 Mar 2022

“Structural basis of phosphatidylinositol 3-kinase C2α function”

https://www.nature.com/articles/s41594-022-00730-w


08 Mar 2022

“Ensemble cryo-EM reveals conformational states of the nsp13 helicase in the SARS-CoV-2 helicase replication–transcription complex”

https://www.nature.com/articles/s41594-022-00734-6


10 Mar 2022

“Structure of the decoy module of human glycoprotein 2 and uromodulin and its interaction with bacterial adhesin FimH”

https://www.nature.com/articles/s41594-022-00729-3




Nature Communications


08 Mar 2022

“Differential recognition of canonical NF-κB dimers by Importin α3”

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28846-z


08 Mar 2022

“Structural snapshots of V/A-ATPase reveal the rotary catalytic mechanism of rotary ATPases”

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28832-5


10 Mar 2022

“Improved prediction of protein-protein interactions using AlphaFold2”

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28865-w


10 Mar 2022

“Atomic structure of the predominant GII.4 human norovirus capsid reveals novel stability and plasticity”

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28757-z


10 Mar 2022

“An open-like conformation of the sigma-1 receptor reveals its ligand entry pathway”

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28946-w


11 Mar 2022

“Structural basis for modulation of human NaV1.3 by clinical drug and selective antagonist”

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28808-5


11 Mar 2022

“The structural basis for regulation of the glutathione transporter Ycf1 by regulatory domain phosphorylation“

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28811-w




Cell Research

本周无



清华大学结构生物学高精尖创新中心作为首批13个北京市高校高精尖创新中心之一,于2015年10月正式挂牌成立,以清华大学为依托和牵头单位。中心主任为著名生物学家施一公教授,执行主任为王宏伟教授。中心瞄准国际前沿,发挥集体优势,不仅在传统的X-射线晶体学领域引进了一批优秀的青年科学家攻坚生物学难题,而且在冷冻电镜领域提前布局,建设了极富国际影响力的冷冻电镜平台,更成为我国基础研究领域为数不多领跑世界的科研机构。

结构生物学高精尖创新中心期待与您一起见证、成长……


作者 | 谭佳鑫

编辑 | 囡囡